Схема динамики RyR-каналов в решетке высвобождающей единицы

Для моделирования динамики RyR-каналов в решетке высвобождающей единицы можно пренебречь существованием инактивационного состояния, подробно описанного во второй главе данной работы, в связи с тем, что характерные времена работы внутриклеточных Са²⁺-«часов» малы по сравнению с характерными временами перехода RyR-канала в инактивационное состояние [24]. В дальнейшем использована простейшая схема открытия/закрытия RyR-каналов в процессе заполнения/высвобождения Са²⁺.

Данная схема (рис. 2.12) включает в себя процессы электронной активации (стрелка 1), медленную конформационную динамику (стрелка 2) и, наконец, туннелирование из метастабильного состояния в глобальный максимум (стрелка 3).

Для упрощения в формуле вероятности электронных переходов (2.8) предполагалось , так что и не зависит от энергии ионов . Зависимость вероятности электронной активации от концентрации полагалась “пороговой”:

, (2.21)

где – амплитуда вероятности электронных переходов, α – параметр, – некоторое критическое значение уровня . Для наглядности зависимость приведена на рисунке 2.13.