Виды ДНК проб. Применение в цитогенетический практике

По своей диагностикой характеристике ДНК пробы подразделяются на:

· Центромерные зонды

· Локус-спецефические ДНК пробы (LSI)

· Субтеломерные зонды ДНК пробы

· Зонды полного окрашивания хромосом

Цетромерные ДНК пробы – состоят из высокоповторяющихся L-сотелитных повторов и используются для идентификации численных хромосомных аномалий, а также для исследования гетероморфизма хромосом при проведение количественного fish-анализа.

Наиболее часто центрометромерные ДНК пробы направлены на выявление численных аномалий хромосом – 1,2,3,6,7,8,10.11,12,15,16,17,18,20,Х,У.

Хромосомы 4 и 9, 5и 19, 13 и 21, 14 и 22 содержат практически одинаковые варианты альфоидной ДНК.

Центромерные ДНК пробы чаще всего используются при натальной диагностике, также при онкологии (выявление численных 3,7,17 – аномалий у хромосом при карциноме мочевого пузыря).

Недостатком является: они не способны отличать интактную хромосому от ее производной (синдром Шершевского-Тернера), используется при контроле качества спермы донора, а также экспресс-диагностика ранних выкидышей и неразвивающей беременности и ЭКО.

Локус-специфические ДНК пробы – уникальные последовательности ДНК, локализованные в районе хромосомы, потеря которого приводит к развитию синдрома.

Применение данных зондов показано для идентификации структурных перестроек, т.е. для выявления сайтов разрыва при транслокацтт, инверсиях, делециях, инсерциях и микроделециях.

Субтеломерные ДНК пробы – к ним относят теломерные ДНК спецефичные к субтеломерным и теломерным участкам ДНК.

Они позволяют выделить субтеломерные, теломерные делеции и дупликации, а также маркировать индивидуальные хромосомы. Субтеломерные ДНК пробы используются для выявления причин умственной отсталости неясной этиологии.

Зонды полного окрашивания хромосом – переставляет собой набор уникальных последовательностей ДНК, равномерно распределенных вдоль всей длины определенной хромосомы.

Отличительная особенность: используется только на метафазных хромосомах (Не используется на интерфазных хромосомах).

Их применяют для идентификации маркерных хромосом, а также для идентификации сложных структурных перестроек с вовлечением нескольких хромосом.

Недостатки: не дают возможность регистрировать внутрихромосомные перестройки.