Гамильтониан канала

При описании свойств RyR-канала предполагается, что на его энергетическое состояние оказывают влияние следующие основные факторы:

· конформационное состояние канала,

· взаимодействие электронной и конформационной степени свободы,

· концентрация Са²⁺ в люмене СР.

Используя псевдоспиновый формализм[101], в рамках энергетического подхода к описанию состояний канала вводится модельный гамильтониан:

(2.1)

где , – матрицы Паули.

В (2.1) первое слагаемое описывает разницу энергий двух электронных состояний канала («открыт» и «закрыт» ), второе слагаемое описывает «перемешивание» и состояний; параметры h и Δ являются аналогами некоторого «эффективного поля». Третий член описывает эффекты воздействия на канал со стороны внешних сил, которые условно можно связать с эффективным давлением (p – параметр «эффективного давления» Са²⁺ в люмене СР). Четвертый член характеризует электронно-конформационные взаимодействия, возникающие в каналах, где – постоянная взаимодействия. Последнее слагаемое описывает упругую энергию конформационного состояния канала с константой упругости K.