Вычисление коэффициента возрастания гомозиготности (инбридинга)

Способ учета родственных спариваний по методу Шапоружа и Пуша, путем учета рядов предков прост, удобен, нагляден. Пользуясь этим методом по родословной можно быстро обнаружить наличие инбридинга и легко установить его степень. Однако он не дает количественной характеристики степеней инбридинга.

Этот пробел восполнил американский ученый С. Райт. В 1921 году им предложен метод количественного учета степени инбридинга с помощью специальной формулы. Применяя эту формулу, вычисляют коэффициент инбридинга или коэффициент возрастания гомозиготности. Впоследствии русский профессор Д.А. Кисловский несколько видоизменил эту формулу

где F – коэффициент инбридинга;

n – ряд родословной, в которой встречается общий предок с материнской стороны;

n₁ – ряд родословной, в которой встречается общий предок с отцовской стороны;

fa – коэффициент инбридинга на общего предка.

Эта формула используется для вычисления возрастания гомозиготности при инбридинге на одного предка.

В случае комплексного инбридинга (на нескольких предков) для учета возрастания гомозиготности по всем предкам отдельные значения, полученные по каждому предку, суммируются. Для облегчения работы по вычислению F удобно пользоваться приведенными ниже данными.

Разные степени для вычисления коэффициента инбридинга:

(1/2)¹ = 0,5 (½)⁷ = 0,0078125

(1/2)² = 0,25 (½)⁸ = 0,00391

(1/2)³ = 0,125 (½)⁹ = 0,001193

(1/2)⁴ = 0,0625 (½)¹⁰ = 0,0078125

(1/2)⁵ = 0,03125

(1/2)⁶ = 0,001563

Рассчитаем коэффициент инбридинга по Райту для хряка Леопарда 2897. В материнской и отцовской стороне родословной Леопарда 2897 общий предок Леопард 681 встречается в четвертом ряду. Подставив соответствующие значения в формулу вычисления инбридинга получим:

F = (1/2)^4+4-1 = (1/2)⁷х100 = 0,78125

Поскольку в данной родословной нет других повторяющихся предков, как и отсутствует общий предок, который был бы сам инбредирован, поэтому вторая часть формулы при расчетах не используется.

Вычисленный нами коэффициент инбридинга свидетельствует о том, что при данной степени родственного спаривания у поколения, к которому принадлежит хряк Леопард 2897, гомозиготность возросла по сравнению с исходным поколением в среднем на 0,78125.

В таблице 12 приведены сведения о степени тесноты инбридинга, определенного с использованием разных методов.

Date: 2015-07-24; view: 2602; Нарушение авторских прав