Схема В. Номенклатура пептидов. При написании формул пептидов необходимо:

При написании формул пептидов необходимо:

· выделять пептидные связи,

· указывать N- и С-концы пептида,

· уметь строить полное и краткое название пептида

· указывать характер среды в водном растворе данного пептида.

Расчет изоэлектрической точки моноаминомонокарбоновых кислот осуществляется по формуле:

рI = (pK_coo^- + pK_NH3⁺) / 2

Значения pK карбоксильной и аминогруппы, а также дополнительных ионогенных групп, содержащихся в радикале, представлены в таблице 1.2

Таблица 1.2 Величины рК ионизированных групп некоторых аминокислот (25⁰С)

Аминокислота	рК1, α-СООН	рК2, α-NH	рК3, R-группа
Аланин	2,34	9,69	–
Аргинин	2,17	9,04	12,48 (гуанидин)
Аспарагин	2,02	8,80	–
Аспарагиновая кислота	2,09	9,82 (NH )	3,86 (СООН)
Валин	2,32	9,62	–
Гистидин	1,82	9,17 (NH )	6,0 (имидазол)
Глицин	2,34	9,60	–
Глутамин	2,17	9,13	–
Глутаминовая кислота	2,19	9,67 (NH )	4,25 (СООН)
Изолейцин	2,36	9,68	–
Лейцин	2,36	9,60	–
Лизин	2,18	8,95	10,53 (ε-NH )
Метионин	2,28	9,21	–
Оксипролин	1,92	9,73	–
Пролин	1,99	10,96	–
Серин	2,21	9,15	–
Тирозин	2,20	9,11	10,07 (ОН)
Треонин	2,71	9,62	–
Триптофан	2,38	9,39	–
Цистеин	1,71	8,33	10,28 (SH)

Пример 1: рассчитайте значение ИЭТ аминокислоты аланина.

Используя данные таблицы 1.2 находим, что значения pK_coo^- и pK_NH3⁺ составляют соответственно 2,34 и 9,69

Отсюда рI_{аланина} = (pK_coo^- + pK_NH3⁺) / 2 = (2,34+9,69) / 2= 6,21

Пример 2: рассчитайте суммарный заряд аланина при рН равном 1,5 7,0 и 11,0. Определите направление перемещения аминокислоты под действием электрического поля в указанных условиях.

При значении рН<< рI аминокислоты превращаются в катион, имеют положительный заряд и под действием электрического поля перемещаются в сторону катода.

При значении рН>> рI аминокислоты превращаются в анион, имеют отрицательный заряд и под действием электрического поля перемещаются в сторону анода.

Следовательно, при рН 1,5 аланин является катионом и под действием электрического поля перемещаются в сторону катода. При рН 7,0, близком к значению рI данной аминокислоты, суммарный заряд равен 0. Аминокислота электрофоретически неподвижна. При рН 11,0 аланин является анионом и под действием электрического поля перемещаются в сторону анода.

В случае аминокислот, имеющих дополнительные ионогенные группы в радикале, для расчета суммарного заряда молекулы при данных условиях, значения рК каждой ионогенной группы сопоставляются со значением рН раствора:

- для групп, диссоциирующих по кислотному типу, диссоциацией практически пренебрегают, если рН < рК

- для групп, диссоциирующих по основному типу, диссоциацией практически пренебрегают, если рН > рК