Строение и классификация аминокислот

Существуют различные классификации аминокислот, входящих в состав белков в зависимости от признака, положенного в основу их деления на группы. Так по химической природе боковой цепи a-аминокислоты делятся на алифатические (ациклические), ароматические, гетероциклические.

I. Алифатическиеa - аминокислоты

1. Моноаминомонокарбоновые (нейтральные)

Алифатические аминокислоты, содержащие в боковой цепи дополнительную функциональную группу.

а) гидроксильную группу (оксиаминокислоты)

Б) карбоксильную группу (моноаминодикарбоновые)

в) амидную группу

г) аминогруппу (диаминомонокарбоновые)

Д) серусодержащие

II. Ароматические аминокислотыIII. Гетероциклические аминокислоты

IV. Иминокислота

Вместе с тем в настоящее время общепринятой является классификация аминокислот на основе признаков, свойственных R-группам, в частности, их полярности, т.е. способности R-групп взаимодействовать с водой при биологических значениях рН=7,0. Это обусловлено наличием в боковой цепи аминокислот различных функциональных групп. Так к неполярным гидрофобным группам (водоотталкивающим) относятся алкильные радикалы, бензольное кольцо.

Гидрофильными (полярными) группами являются группы: -ОН, -SН, -СООН, - NН₂, ядро имидазола. Гидрофильность - это свойство молекул или групп, имеющих полярную природу, легко взаимодействовать с водой. Полярные функциональные группы, способные к ионизации, называют ионогенными, они несут отрицательный заряд, если отщепляют протон или положительный заряд, если его принимают.

В связи с этим все 20 аминокислот по свойствам боковой цепи можно разделить на 4 группы:

1 )неполярные гидрофобные,

Полярные неионные,

Полярные отрицательно заряженные,

Полярные положительно заряженные.