Полезные скрипты

Каждый пользователь кластера может написать собственные скрипты, которые могут быть полезны для управления машиной. Приведем три примера таких скриптов

1) Скрипт отчистки mpd

$ cat mpi_clean_all.sh
#!/bin/bash
NODES=56
for ((i=1; i<=NODES; i++))
do
echo "n$i clean complete"
ssh "n$i" mpdcleanup
done
mpdallexit
exit 0

2) Скрипт запуска mpi

$ cat mpi_start
mpdboot -n $(grep n hostfile | wc -l) -f hostfile -v
mpdtrace

3) Скрипт отслеживания доступных нодов
$ cat how_many_nodes_free.sh
#!/bin/bash
NODES=56
for ((i=1; i<=NODES; i++))
do
echo "n$i"
ssh "n$i" ps -Ao pcpu,user --sort user | grep -e '^.\?[0-9]\{2,3\}'
done
exit 0

3 Копирование файлов:

При копировании файлов с компьютера на вычислительный кластер (программы, входные данные, различные библиотеки и т.п.) и обратно (листинги, результаты расчетов) пользователем должен использоваться протокол sftp. Этот протокол обеспечивает необходимую защиту передаваемой информации посредством шифрования всех передаваемых данных.

Копирование файлов осуществляется при помощи утилиты scp (для Windows-пользователей, использующих PuTTY – pscp). Формат этой команды эквивалентен стандартной команде копирования файлов cp. Копирование файлов в SSH Secure Shell Client реализовано через знакомый пользователям Windows интерфейс.

Многие пользователи Windows возможно предпочтут пользоваться более привычными графическими оболочками. Существует свободно распространяемая программа WinSCP, представляющая собой клиент в стиле проводника Windows или Norton Commander по выбору пользователя. Скачать в интернете. Для любой из программ настройки минимальны: адрес сервера и порт номер 22.

Примечание:

Максимальный размер домашней директории пользователя может быть ограничен. Пользователям не следует хранить на сервере файлы, не относящиеся напрямую к заявленным в целях.

4 Работа на кластере:

Для работы на вычислительном кластере удобно пользоваться файловым менеджером Midnight Commander, который включает редактор текстовых файлов. Универсальным способом работы на кластере является работа через консоль. Оба способа кратко описаны ниже.