RAPD-PCR

В основе RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction) лежит использование праймеров с произвольной случайной последовательностью. В настоящее время этот метод используется для решения теоретических и практических задач фундаментальной и частной генетики в изучении генома – конструирование генетических карт, анализ генетической структуры популяций, генотипирование, маркирование признаков [Харченко П.Н., Глазко В.И., 2006].

Несмотря на распространенность RAPD-анализа, это метод не лишен недостатков. Известно, что количество ДНК, используемое для анализа, существенно влияет на результат ПЦР. Концентрация ионов магния также влияет на количество и интенсивность продуктов амплификации. Кроме того, праймеры, используемые в RAPD, являются "случайной" затравкой. Это означает, что различные участки генома могут быть в большей или меньшей степени гомологичны последовательности праймера. Таким образом, незначительные изменения условий реакции может повлиять на ход реакции и ее продукт.

RAPD-анализ используется для исследования генетического разнообразия пород крупного рогатого скота и установление их родственных связей [Глазко и др., 1999]. Этот метод позволяет решать задачи по выяснению генетического разнообразия, для решения спорных вопросов систематики и филогении различных таксономических групп животных [Сулимова Г.Е. 2006].

Зубец М.В. с соавторами выявили 116 полиморфных локусов с помощью RAPD-анализа трех пород КРС (украинская красно-пестрая молочная, голштинская и симментальская). На основании значений RAPD-локусов и алгоритма Нея и Ли составили суммарную схему, отражающую генетические взаимоотношения между анализируемыми породами [Зубец М.В. и др., 2001].