tracejob 123

Часто пользователю необходимо знать, какие узлы и процессоры свободны в настоящий момент. Для этого пользователь может использовать команду pbsnodes. Данная команда выводит список узлов с указанием состояния (state) каждого узла. Состояние free означает, что узел не выполняет никакую задачу, т.е. свободен. Состояние job-exclusive означает, что узел занят выполнением задачи, а состояние down указывает на то, что данный узел в настоящий момент не доступен.

PS. Шпаргалка по командам Linux и Unix систем:

Управление процессами |

ps – вывести ваши текущие активные процессы
top – показать все запущенные процессы
kill pid – убить процесс с id pid
killall proc – убить все процессы с именем proc
bg – список остановленных и фоновых задач; продолжить выполнение остановленной задачи в фоне
fg – выносит на передний план последние задачи
fg n – вынести задачу n на передний план
Права доступа на файлы
chmod octal file – сменить права file на octal, раздельно для пользователя, группы и для всех добавлением:
4 – чтение (r)
2 – запись (w)
1 – исполнение (x)

Примеры:
chmod 777 – чтение, запись, исполнение для всех
chmod 755 – rwx для владельца, rx для группы и остальных.
Дополнительные опции: man chmod.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
SSH |

ssh user@host – подключится к host как user
ssh -p port user@hos t – подключится к host на порт port как user
ssh-copy-id user@host – добавить ваш ключ на host для user чтобы включить логин без пароля и по ключам
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Поиск |

grep pattern files – искать pattern в files
grep -r pattern dir – искать рекурсивно pattern в dir
command | grep pattern – искать pattern в выводе command
locate file – найти все файлы с именем file
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Системная информация |

date – вывести текущую дату и время
cal – вывести календарь на текущий месяц
uptime – показать текущий аптайм
w – показать пользователей онлайн
whoami – имя, под которым вы залогинены
finger user – показать информацию о user
uname -a – показать информацию о ядре
cat /proc/cpuinfo – информация ЦПУ
cat /proc/meminfo – информация о памяти
man command – показать мануал для command
df – показать инф. о использовании дисков
du – вывести “вес” текущего каталога
free – использование памяти и swap
whereis app – возможное расположение программы app
which app – какая app будет запущена по умолчанию
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Архивация |

tar cf file.tar files – создать tar-архив с именем file.tar содержащий files
tar xf file.tar – распаковать file.tar
tar czf file.tar.gz files – создать архив tar с сжатием Gzip
tar xzf file.tar.gz – распаковать tar с Gzip
tar cjf file.tar.bz2 – создать архив tar с сжатием Bzip2
tar xjf file.tar.bz2 – распаковать tar с Bzip2
gzip file – сжать file и переименовать в file.gz
gzip -d file.gz – разжать file.gz в file
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Сеть |

ping host – пропинговать host и вывести результат
whois domain – получить информацию whois для domain
dig domain – получить DNS информацию domain
dig -x host – реверсивно искать host
wget file – скачать file
wget -c file – продолжить остановленную закачку
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Установка пакетов |

Установка из исходников:
./configure
make
make install
dpkg -i pkg.deb – установить пакет (Debian)
rpm -Uvh pkg.rpm – установить пакет (RPM)
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Клавиатурные сочетания |

Ctrl+C – завершить текущую команду
Ctrl+Z – остановить текущую команду, продолжть с fg на переднем плане или bg в фоне
Ctrl+D – разлогиниться, тоже самое, что и exit
Ctrl+W – удалить одно слово в текущей строке
Ctrl+U – удалить строку
!! - повторить последнюю команду
exit – разлогиниться

5 Полезные ссылки:

http://www.parallel.ru – Сайт лаборатории Параллельных информационных технологий Научно-исследовательского вычислительного центра МГУ. Большое количество информации о параллельных вычислениях. Новости, технологии, компиляторы и многое другое.

http://www.open-mpi.org - Сайт разработчиков MPI-дистрибутива OpenMPI. FAQ по использованию OpenMPI.

http://mvapich.cse.ohio-state.edu - Сайт разработчиков MPI-дистрибутивов MVAPICH и MVAPICH2. Документация по использованию MVAPICH и MVAPICH2.

http://classic.chem.msu.su/gran/gamess - Сайт разработчика программы расчетов химии PCGAMESS.

http:// www.fftw.org – Сайт разработчиков библиотеки быстрый преобразований Фурье FFTW.

http://www.clusterresources.com/pages/products/torque-resource-manager.php - Страница разработчиков менеджера ресурсов Torque. Большое количество документации по настройке и использованию Torque.

http://math-atlas.sourceforge.net - Страница разработчиков библиотеки ATLAS (Automatically Tuned Linear Algebra Software).

http://www.tacc.utexas.edu/resources/software/#blas - Страница разработчиков библиотеки GotoBLAS.

http://www.intel.com - Официальный сайт корпорации Intel, производителя микропроцессоров и комплектующих, компиляторов языков программирования СИ++ и Фортран-90, библиотеки MKL и др. программного обеспечения для проведения параллельных вычислений.

http://www.gromacs.org - Официальный сайт программной системы проведения расчетов молекулярной динамики GROMACS.

http://www.ansys.com – Официальный сайт компании ANSYS Inc, производителя программного пакета ANSYS.

http://top500.org – Сайт, публикующий список 500 самых производительных суперкомпьютеров в мире.

http://cb.vu/unixtoolbox.xhtml - Сайт, с огромным кол-во все возможных команд.