Полезное:
Как сделать разговор полезным и приятным
Как сделать объемную звезду своими руками
Как сделать то, что делать не хочется?
Как сделать погремушку
Как сделать так чтобы женщины сами знакомились с вами
Как сделать идею коммерческой
Как сделать хорошую растяжку ног?
Как сделать наш разум здоровым?
Как сделать, чтобы люди обманывали меньше
Вопрос 4. Как сделать так, чтобы вас уважали и ценили?
Как сделать лучше себе и другим людям
Как сделать свидание интересным?
Категории:
АрхитектураАстрономияБиологияГеографияГеологияИнформатикаИскусствоИсторияКулинарияКультураМаркетингМатематикаМедицинаМенеджментОхрана трудаПравоПроизводствоПсихологияРелигияСоциологияСпортТехникаФизикаФилософияХимияЭкологияЭкономикаЭлектроника
|
Моделирование пространственных структур белковВ настоящее время существует единственный метод моделирования пространственной структуры белка, дающий достаточно точные модели, пригодные для технологии SBDD. Это метод моделирования структуры белка по гомологии, основанный на схожести первичных и пространственных структур исследуемого белка и его гомологов, для которых пространственная структура известна. Широкомасштабные эксперименты показали, что точность модели белка, построенной по гомологии, зависит от схожести последовательностей моделируемого белка и белка-гомолога. Как правило, хороший результат получается, когда идентичность последовательностей превышает 40%. При идентичности менее 30% точность расчетов резко уменьшается. 2.1.4. Конечная селекция и приоритезация потенциальных мишеней В настоящее время этот самый критический этап процесса создания новых лекарств может быть выполнен только вручную. На данном этапе производится оценка возможных финансовых и временных затрат и ряда плохо формализуемых критериев типа функции белка и его метаболической роли. Преимущественно это функция белка и его метаболическая роль. К предпочтительным мишеням относят ферменты клеточной стенки, компоненты синтеза витаминов, компоненты систем транскрипции и трансляции. Предпочтительны также ферменты, катализирующие ключевые стадии метаболизма. Что касается структурных и транспортных белков, а также ферментов альтернативных метаболических путей, то их лучше исключать из списка потенциальных мишеней. С технологической точки зрения более предпочтительны водорастворимые белки по сравнению с мембранными. В последнее время активно разрабатываются высокопроизводительные технологии экспериментальной проверки — валидации потенциальных мишеней (high-throughput target validation). Они позволяют проводить проверку примерно 10% всех белков, кодированных типичным бактериальным геномом.
|