Критика. Сразу же после выхода и появления на прилавках магазинов игра стала объектом жёсткой критики и жалоб игроков

Сразу же после выхода и появления на прилавках магазинов игра стала объектом жёсткой критики и жалоб игроков. Причиной тому послужило огромное количество внутренних ошибок игры, из-за которых игровой процесс был весьма затруднительным. Практически сразу же появились первые патчи. Также на многих игровых форумах горячими темами обсуждения становились именно скриптовые вылеты S.T.A.L.K.E.R.: Чистое небо^[5].

Также объектом жалоб игроков стали системные требования игры. Взамен отличной графике и эффектам игра выставила компьютерам немалые требования к компонентам. Указанной в документации «оптимальной конфигурации» не всегда хватало, чтобы получить стабильный фреймрейт при высокой детализации. Для игры в среде DirectX 10 с максимальными настройками графики в документах предлагалась «супер-конфигурация». Однако её составляющие были экстремально дорогими. Жалобы от игроков на низкую производительность даже на мощнейших системах также негативно сказались на репутации игры.

Кроме этого, критике игроков подверглась и сама концепция приквела, в котором Зона Отчуждения превратилась из загадочного и мистического места в некое подобие реконструкции битвы за Сталинград^[6].

Спорными стали также изменения геймплея — с одной стороны, повысилась реалистичность, с другой — появилось больше элементов чистого шутера. Это привело к тому, что отдельные эпизоды игры (например уровни «Лиманск», «Заброшенный Госпиталь» и «ЧАЭС») превратились в линейную кровавую бойню. Улучшенный AI также докучал игрокам: вражеские персонажи научились идеально точно бросать в игрока гранаты и метко стрелять вне зависимости от уровня сложности, а персонажи-союзники — умело выталкивать его из укрытий.