элонгация

а)построение праймеров (с помощью праймазы)

б)ДНК полимераза 3 вытесняет вспомогательные белки и начинает строить ДНК, использующий, как затравку, праймер.

Цепь, где идёт построение в правильном направлении и для которой достаточно одного праймера, называется лидирующей.

Цепь, строющаяся через фрагменты Оказаки, называются запаздывающие.

в)ДНК полимераза 1 РНК на ДНК

г)лейгаза сшивает отдельные фрагменты ДНК

д)метилаза метилирует некоторые нуклеотиды, привращает их в минорные.

Терминация

Вилка доходит до точки ори

ДНК отсоединяются друг от друга с помощью топо-изомеразы и вспомогательных негистоновых белков, восстанавливающих супер-спирализацию ДНК.

Билет

Отличие репликации у эукариот

1)у нас она протекает медленнее (у бактерий 8 минут, а у человека 8 часов, т.к.

у нас 2м ДНК)

2)у нас много вилок репликации (иначе синтез новой ДНК шёл больше суток)(полилиприконный метод репликации)

3)у нас другие ферменты

4)у нас ДНК намотана на гистоны

проблема гистонов: нуклеосома расходится на 2 полунуклеосомы, в каждой по 4 полекулы гистона из 8.

5)у бактерий ДНК кольцевая, а у нас линейная (проблема теломеров)

Оловников в нач 70-х предложил объяснение этому(ДНК укорачивается с 2-х концов).

До этого это была проблема Хейфлика (у ДНК теряется с прошествием времени её часть)

Только стволовые, раковые и половые клетки могут делится бесконечное число раз.

В них есть ферм. который доращивает их после каждого деления.

Билет

Транскрипция - синтез РНК по матричной ДНК.

Единица транскрипции -оперон.

У эукариотов - транскриптон.

Особенности транскрипции:

матрицей является нить ДНК

проблема:какая ДНК является матричной?

Условия транскрипции (постройки РНК)

1)матрица

2)4 рибонуклеозид 3 фосфата

3)ферменты (РНК полимеразы)

А) у прокариотов

Единственная РНК полимераза

Она определяет какую РНК надо сделать (насадка на пылесос)

Б) у эукариотов

РНК полимеразы 1 синтезируют большие рРНК (18 S, 28 S, 5,8 s)

РНК полимеразы 2 синтезируют матричную РНК

рРНК 3 синтезируют рРНК, тРНК

4)для репликации нужны вспомогательные белки

А)прокариоты

Белков мало и для присоединения РНК полимеразы они не нужны

В)эукариоты

Чуть меньше 100, но без белков не пойдёт транскрипция. (белковые факторы)

1)транскрипции(они строят «причал» для строения РНК

2)лангации (регулируют скорость движения)

3)терминации (нужны для отсоединения РНК от ДНК и завершения процесса)

Общие белковые факторы подходят для любого процесса.

Билет

Билет

Единица танскрипции-транскриптон

Билет

1)инициация

Сигма субъединица находит промотор, затем к ней присоединяется субъединица ДНК полимеразы и раскусывает цепи.

2)Элонгация

Если оператор разрешает присоединится, то ДНК полимераза строит РНК.

3)Терминация

Подходят специальные белки, которые помогают закончить процесс.

Билет

1)для присоединения надо много белков

2)считывает в помощью движения

3)нужны специальные белки терминации

4)Много РНК полимераз

Билет

Процессинг состоит в:

1)модификации предцистронной зоны и присоединения КЭПА (особой нуклеотидной последовательности) (защита 5’конца)

При кэпировании происходит присоединение к 5'-концу транскрипта 7-метилгуанозина посредством трифосфатного моста, соединяющего их в необычной позиции 5'-5', а также метилирование рибоз двух первых нуклеотидов. Процесс кэпирования происходит во время транскрипции молекулы пре-мРНК. Кэпирование защищает 5'-конец первичного транскрипта мРНК от действия рибонуклеаз, специфически разрезающих фосфодиэфирные связи в направлении 5’→3'.[1]:221

Функции кэпа и связанных с ним белков:

экспорт мРНК из ядра;

защита 5'-конца транскрипта от экзонуклеаз;

участие в инициации трансляции;

участие в полиаденилировании.

2) (Полиаденилирование) Надо защищать 3’ конец. именно на него садятся много «А», их кол-вом определяется сколько раз РНК должна пройти через рибосому (на один проход – один «А»)

3)сплайсинг-вырезание интринов из мРНК

После полиаденилирования мРНК подвергается сплайсингу, в ходе процессе которого удаляются интроны (участки, которые не кодируют белки), а экзоны (участки, кодирующие белки) сшиваются и образуют единую молекулу [2]. Сплайсинг катализируется крупным нуклеопротеидным комплексом — сплайсосомой, состоящей из белков и малых ядерных РНК. Многие пре-мРНК могут быть подвергнуты сплайсингу разными путями, при этом образуются разные зрелые мРНК, кодирующие разные последовательности аминокислот (альтернативный сплайсинг)(т.е. например с ДНК образовалась РНК а образовалась в глазу, и ей нафиг не надо лишних последовательностей(печени), они и вырезаются).

Билет

Белки

1)нерегулируемого синтеза

Синтез постоянно идёт (синтез фермента, расщепляющего глюкозу)

2)регулируемого синтеза

А)репрессируемые

Всегда включены и иногда выключаются.(фермент синтеза триптофана)

Б)индуцибельные

Всегда выключены и включаются тогда, когда надо. (лактоза)

Индуцибельные ферменты

Регулятор мРНК постоянно вырабатывает белок-репрессор ,который подлетает к оператору

и не даёт строится РНК (мешает двигать).

Но если появляется лактоза , то она отшибает белок-репрессор, и РНК начинает синтез фермента, который расщепляет лактозу (ABC)

Билет

Регуляторная мРНК строит «ущербный» белок , который активируется только триптофаном

После активации он блокирует выработку триптофанов, а после снижения их концентрации он начинает их опять вырабатывать.

Билет

Пространственная (третичная) структура тРНК

Изображение тРНК в виде клеверного листа на плоскости имеет такое же отношение к реальной пространственной структуре молекулы, как развертка куба, изображенная на листе бумаги, к трехмерному кубу. Впервые трехмерная структура тРНК была установлена в 1974 году для дрожжевой фенилаланиновой тРНК с помощью рентгеноструктурного анализа ее кристаллов. С тех пор удалось закристаллизовать и расшифровать пространственную структуру еще почти десятка тРНК из дрожжей и кишечной палочки.

Общие принципы складывания цепей различных тРНК в компактную третичную структуру оказались универсальными. За счет взаимодействия элементов вторичной структуры формируется третичная структура, которая получила название L-формы из-за сходства с латинской буквой L (рис. 2 и 3). За счет стэкинга оснований акцепторный стебель и T-стебель клеверного листа образуют одну непрерывную двойную спираль (одну из "палочек" - доменов буквы L), а два других стебля - антикодоновый и D - другую непрерывную двойную спираль (второй домен L). При этом D- и T-петли оказываются сближенными и скрепляются между собой путем образования дополнительных, часто необычных пар оснований. В образовании этих пар, как правило, принимают участие консервативные или полуконсервативные остатки. В свете этого становится ясным, зачем они присутствуют в D- и T-петлях. Аналогичные третичные взаимодействия скрепляют и некоторые другие участки L-структуры. CCA-конец тРНК и ее антикодоновый триплет находятся на максимальном удалении один от другого (расстояние около 8 нм), причем основания антикодона обращены внутрь угла L-образной молекулы. Любители загадочных картинок могут проследить ход нуклеотидной цепи тРНК в трехмерной структуре на рис. 3, основываясь на схематическом изображении рис. 2, б.

Количество рРНК в каждой субъединице